Timor Est presenta un clima molto diversificato, con differenze marcate tra le regioni. Le temperature annuali variano da minimi di -24°C nelle regioni più fredde a massimi di 46°C nelle zone più calde. Le precipitazioni annuali vanno da 104mm nelle regioni più secche a 390mm nelle zone più umide del paese. Alcune regioni ricevono nevicate significative, fino a 390cm all'anno, mentre altre zone vedono poca o nessuna neve. Le zone più calde sono caldo tutto l'anno, mentre le regioni più fredde restano molto freddo, rendendo Timor Est un paese dai forti contrasti climatici.

Le temperature in Timor Est variano per regione, con differenze marcate tra le diverse zone. Il Sudovest è la zona più calda del paese, con temperature massime che raggiungono 46°C e una media annuale di 29°C. Condizioni più fresche si trovano al Est, dove le minime invernali scendono a -24°C e la media annuale è di -9°C. Questa differenza di 38°C nelle medie annuali tra le regioni significa che i viaggiatori possono incontrare condizioni molto diverse a seconda della zona di Timor Est che visitano. Le maggiori differenze regionali emergono in estate, con variazioni fino a 44°C in tutto il paese. Ad esempio, Same nel Manufahi registra una media annuale di 29°C, mentre Irabin de Baixo nel Viqueque registra una media di -9°C.

Timor Est presenta variazioni pluviometriche significative tra le regioni, da 104mm a 390mm all'anno. Il Ovest riceve le maggiori precipitazioni, con circa 390mm annui. Il Sudovest è il più secco, con circa 104mm all'anno. Le precipitazioni si distribuiscono in modo abbastanza uniforme nel corso delle stagioni, senza periodi particolarmente secchi o piovosi nella maggior parte delle regioni. Il Ovest riceve le maggiori nevicate, con fino a 390cm all'anno, mentre altre parti del paese vedono poca o nessuna neve. Nelle zone più piovose è possibile aspettarsi piogge più frequenti rispetto alle parti più secche del paese.